微生物高通量测序平台

生工人、大、小鼠全基因组测序，项目介绍：人或者大、小鼠全部基因组重测序，研究其突变信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注释突变位点信息。该技术可同时获取编码区及非编码区突变信息，被广泛应用于遗传病、tumour及其它其它疾病研究中。测序平台：HiSeq XTen平台进行PE150测序。生工微生物基因组测序，项目介绍：微生物基因组重测序（有参）目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。截止目前为止，生工生物可是为数不多的同时拥有ChromiumController和ChromiumX平台的公司。微生物高通量测序平台

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种)，项目介绍：长链非编码RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA比例是1%）。近年来研究表明，LncRNA参与了多种重要的调控过程，如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序，可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化，从而促进LncRNA的深入研究。微生物高通量测序平台RNA样品建议用足量干冰运输。

small RNA测序，项目简介：Small RNA是一类重要的体内调节分子，长度在18-30 nt之间，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量，从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序使用Illumina Xten平台，测序原始数据质控后，进行Clean reads 长度分布统计，small RNA注释，已知 miRNA 注释，已知piRNA注释，ncRNA分析，新 miRNA 预测（有参考基因组），差异基因可视化分析，miRNA 家族分析，差异表达 miRNA 聚类分析，miRNA靶基因预测，靶基因GO、KEGG富集分析。

细胞质检时染料染色的原理：台盼蓝染色原理：台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜，故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高，可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一种小分子染料，可以通过完整的细胞膜，嵌入所有细胞（活细胞和死细胞）的细胞核，呈现绿色荧光；碘化丙啶（PI）只能通过不完整的细胞膜，即死细胞的细胞膜，嵌入所有死细胞的细胞核，呈现红色荧光，通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞，这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。生物信息分析经验丰富，可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。

生工靶向捕获测序，项目介绍：利用序列捕获技术将基因组特定区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。全外显子测序即通过对某一基因组中的所有外显子进行测序从而获得所有外显子区域内的突变信息。由于该技术在临床上的潜力，被《科学》杂志评为2010年科学进展之一。外显子组测序可用于寻找单基因疾病、复杂疾病（如糖尿病、肥胖症等代谢综合症）、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统，可以高效富集人全外显子区域，并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测，形成完整的分析报告。DNA样品建议用蓝冰运输。上海18s高通量测序项目

对于需要进行RNA抽提的部分特殊样品，可以将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送。微生物高通量测序平台

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一种小分子染料，可以通过完整的细胞膜，嵌入所有细胞（活细胞和死细胞）的细胞核，呈现绿色荧光；碘化丙啶（PI）只能通过不完整的细胞膜，即死细胞的细胞膜，嵌入所有死细胞的细胞核，呈现红色荧光，通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞，这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。荧光细胞计数仪检测结果可以让我们直观的看到：细胞浓度（总细胞，活细胞，死细胞）、细胞存活率（台盼蓝和双荧光AO/PI染色）、细胞平均直径、细胞聚团率、细胞直径分布等结果的展示。微生物高通量测序平台

生工生物工程（上海）股份有限公司汇集了大量的优秀人才，集企业奇思，创经济奇迹，一群有梦想有朝气的团队不断在前进的道路上开创新天地，绘画新蓝图，在上海市等地区的医药健康中始终保持良好的信誉，信奉着“争取每一个客户不容易，失去每一个用户很简单”的理念，市场是企业的方向，质量是企业的生命，在公司有效方针的领导下，全体上下，团结一致，共同进退，**协力把各方面工作做得更好，努力开创工作的新局面，公司的新高度，未来生工生物工程供应和您一起奔向更美好的未来，即使现在有一点小小的成绩，也不足以骄傲，过去的种种都已成为昨日我们只有总结经验，才能继续上路，让我们一起点燃新的希望，放飞新的梦想！